phenotrex package

Subpackages

• phenotrex.cli package
  • Submodules
  • phenotrex.cli.cccv module
  • phenotrex.cli.clf_opt module
  • phenotrex.cli.compute_genotype module
  • phenotrex.cli.cv module
  • phenotrex.cli.generic_func module
  • phenotrex.cli.generic_opt module
  • phenotrex.cli.get_weights module
  • phenotrex.cli.main module
  • phenotrex.cli.plot module
  • phenotrex.cli.predict module
  • phenotrex.cli.train module
  • Module contents
• phenotrex.io package
  • Submodules
  • phenotrex.io.flat module
  • phenotrex.io.serialization module
  • Module contents
• phenotrex.ml package
  • Subpackages
    • phenotrex.ml.clf package
      • Submodules
      • phenotrex.ml.clf.svm module
      • phenotrex.ml.clf.xgbm module
      • Module contents
  • Submodules
  • phenotrex.ml.cccv module
  • phenotrex.ml.feature_select module
  • phenotrex.ml.trex_classifier module
  • phenotrex.ml.vectorizer module
  • Module contents
• phenotrex.structure package
  • Submodules
  • phenotrex.structure.records module
  • Module contents
• phenotrex.transforms package
  • Submodules
  • phenotrex.transforms.annotation module
  • phenotrex.transforms.resampling module
  • Module contents
• phenotrex.util package
  • Submodules
  • phenotrex.util.helpers module
  • phenotrex.util.logging module
  • phenotrex.util.plotting module
  • phenotrex.util.taxonomy module
  • Module contents

Module contents

Top-level package for phenotrex.